PC-98x1ではCD-ROMからのブートはできないので、必ずFDを作ることになります。この場合、1.44M FDであれば、kern.flpをFDに書き込めば事足りるけど、1.2M FDの場合は、HDD環境に合わせてkernide2.flp等を選択してから書き込んであげるといいかも。

kern*.flpを書いたFDをさしてブートします。このときに焼いたCD-Rをセットするのを忘れずに。